La solucion fue quitar todos las salidas visuales HTML creando un archivo PHP independiente solo para mastrar el PDF
<?php require('fpdf/fpdf.php'); $pdf = new FPDF(); $pdf->AddPage(); $pdf->SetFont('Arial','B',16); $pdf->Cell(40,10,'¡Hola, Mundo!'); $pdf->Output(); ?>
Para guardar sin de mostrarlo se puede utilizar colocando los parametros del nombre del archivo en el output
$pdf->output("nombre_archivo.pdf","F")
Si se desea se pueden utilizar variables como por ejemplo
$filename = "nombre_del_archivo.pdf";output($filename,"F");